Le manga est assez court et l'histoire diffère un peu de celle de la série animée qui developpe plus de choses. Je vais comparer ici les différences entre les évènements du Manga par rapport à la série. 

Le manga commence sur le moment ou Nanako demande à son professeur de devenir son frère. On est donc au courant dès le début. C'est aussitôt suivi des souvenir de Takehiko qui regarde la petite fille jouer sous la pluie. 

La voix d'Asaka est décrite comme chaude et profonde, pas claire et cristaline. St Just joue de la guitare et passe dans les classes pour chanter un morceau durant les intercours. 

La relation avec Tomoko se termine assez vite et comme dans l'anime Mariko joue un rôle important. La différence c'est que Tomoko ne reviendra pas avant la fin de l'histoire après que la pétition ait réuni assez de signatures. 

Ce n'est pas Karu qui prête directement ses affaires à Nanako, Mariko les empruntes à une "fille de première"

Lorsque Kaoru à de fortes douleurs et demande à Nanako de demander un calmant à St Just, celle ci joue une pièce de théâtre dans la série, dans le Manga elle joue de la guitare entourée de ses groupies. Petit moment comique très coutumier d'Ikeda lorsqu'elle sort tout ses cachets...

La maman de Nanako porte toujours un kimono dans la série, hors dans le manga on la voit porter une tenue plus occidentable pour son RDV avec Henmi. 

Nanako se rend compte de ses sentiments pour Rei asssez vite. Et se les avoue bien avant la sortie au parc. S'eb suit une conversation très intéressante ente Nanako et Kaoru sur l'amour entre deux personnes. Et une petit échange assez drôle entre Kaoru et Rei à ce sujet dévoile une facette un peu plus fleur bleue de la rebelle Asaka...

Dans la série un incident de mépris envers Nanako au cercle n'est pas montré, comme la scène qui suit ou elle et St Just ont un échange au sujet des entiments de Nanako, Rei embrasse Nanako sur la joue, et Nanako se rend compte à ce moment là que le bracelet n'est pas au bon endroit pour camoufler un suicide. C'est là qu'elle apprend que c'est Fukiko qui a blessé Rei à cet endroit. 

Les circonstances de l'adultère du père de Mariko est aussi différent. Il semblerait que la maîtresse et l'épouse se cotoyaient car elle vivaient sous le même toit. 

La relation entre les deux sœurs cachées est aussi assez différentes. Dans le manga on voit clairement la haine de Fukiko pour Rei, elle lui dit clairement qu'elle la trouve laide et qu'elle se réjouis de sa médiocrité. L'échange et les mots sont très violents. 

Après cet évènement Rei se présente un soir chez Nanako, elles se retrouvent près de la balançoire. Le ton est différent de la série. Rei confie bien à Nanako la vérité sur elle et Fukiko, mais elle lui offre aussi la poupée ce soir là. On en apprend aussi d'avantage sur la façon dont Fukiko à rejeté Rein à la mort de sa mère et à refusé quelle vienne vivre sous le toit de son père. Par contre dans le manga elle ne donne pas de rendez vous à Nanako le lendemain. Cet évènement ne se passe pas non plus pendant les vacances car Nanako est à l'école le lendemain.

La mort d'Asaka est aussi annoncée différement. Un coup de fil de Kaoru au Lycée qui demande Nanako et lui annonce la nouvelle. C'est un suicide avec des cachets, là aussi les circonstances sont différentes. La douleur de Fukiko est aussi montrée de façon plus claire. 

Dans le manga Nanako apprend différement que Kaoru et son frère se connaissent. Elle la surprend avec Henmi, Takashi à un rôle moins important dans cette version de l'histoire. Kaoru se confie à Nanako et la vérité est montrée plus cruement que dans l'animé. 

On apprend aussi d'avantage de détails sur la rencontre du professeur Misono et de la maman de Nanako. La maman de Nanako travaillais dans un restaurant près de l'université et c'est là que le proffesseur Misono venait noyer son chagrin causé par son divorce. Sa femme était partie avec son fils et son amant. C'est là aussi qu'il a rencontré Nanako, cette toute petite fille qui a sans doute touché son cœur de père. 

Pour Kaoru le destin est aussi plus triste car la lettre que reçoit Nanako n'annonce pas une naissance mais le décès de Kaoru. 

Le manga aborde assez peu les sentiments de Fukiko pour Henmi, c'est beaucoup moins détaillé et on ne parle absolument pas de cet été quand Fukiko avait 12 ans. C'est présent car la raison de l'admission de Nanako au cecle reste la même mais les choses sont plus floues. 
Le frère de Fukiko, Takashi est présent dans le manga mais beaucoup moins. Il n'organise pas le mariage de Kaoru et Henmi. 
On ne voit pas non plus les funérailles de Rei, et pas de place de receuillement au bord de la voie ferrée ni d'entrevue entre Kaoru et Fukiko.